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Nel caso potresti usare la libreria narcoleptic per il delay: ti mette in sleep il processore durante i delay() risparmiando un tot la batteria:
- https://code.google.com/p/narcoleptic/

/*
 RC finder
 By: Lanz
 se il canale della ricevente emmette segnale > mille 
 non suona, altrimenti o e' spenta e suona o e' 
 interruttore e suona comunque.
 E' previsto ovviamente che arduino abbia alimentazione separata.
 
 Addendum: narcoleptic delay(): https://code.google.com/p/narcoleptic/
 */
#include <Narcoleptic.h>
int ch1; 

void setup() {
//Serial.begin(9600);
pinMode(0, INPUT); // Set input pin 

}

void loop() {
  
  ch1 = pulseIn(0, HIGH, 25000); // Read the pulse width of 
  
  if(ch1<1300){
    digitalWrite(1, HIGH);   // turn the LED on (HIGH is the voltage level)
    Narcoleptic.delay(1000);              // put the MCU to sleep for 1 sec
    digitalWrite(1, LOW);    // turn the LED off by making the voltage LOW
    Narcoleptic.delay(1000);              // put the MCU to sleep for 1 sec
  }            
}