Le termocoppie venivano usate in passato sui ponti radio prima dell'eolico e funzionavano con buciatori gas ma avevano dei rendimenti infimi, nel tuo caso dovresti montare i moduli TEG con il lato caldo a contatto del mantello della stufa e poi usare un heat-pipe (come quello usato sulle motherboard dei PC) fra quello freddo ed un bel dissipatore a temperatura ambiente posto a distanza.
Fra il lato caldo del TEG e la parete del riscaldatore è bene interporre una pellicola di grafite che aumenta la superficie di contatto e migliora il trasferimento del calore, inoltre conviene isolare le due facce del TEG con del Aerogel.
Tieni presente che il dissipatore si scalderà anche fino a 50..60°C, le celle di Peltier usate al contrario rendono assai meno che le Seebek, avendo in casa un discreto numero di TEG avanzati dal progetto a tempo perso mi sto dilettando a fare prove per un utilizzo domestico con una cucina economica a legna che ho in baita....