Mi interessa molto il tuo progetto e, girovagando in rete, ho trovato qualche sito che potrebbe darti degli spunti:
DIY Drones Infrared Sensors - Paparazzi The arduino based helicopter autopilot
Per le termopile:
IC SENS THERMOPILE W/THERM TO-39 - MLX90247-ESF-DSA
Spero di esserti stato utile...